La Federación se gobierna, tal y como establecen sus Estatutos, por una Directiva elegida cada tres años e integrada por un Consejo Ejecutivo, que ejecuta las directrices tomadas por la Asamblea y por Comisiones Especiales que ejecutan los Proyectos, conjuntamente con las Delegadas de las Asociaciones Provinciales que forman parte de la Federación.